MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 53188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021082	ATA	2	6	180424	180429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884890
3502	NC_021082	AT	4	8	180466	180473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_021082	TTG	2	6	180524	180529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_021082	CTA	2	6	180532	180537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884891
3505	NC_021082	TTTC	2	8	180564	180571	0 %	75 %	0 %	25 %	482884891
3506	NC_021082	TGGC	2	8	180620	180627	0 %	25 %	50 %	25 %	482884891
3507	NC_021082	ACC	2	6	180665	180670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884891
3508	NC_021082	CAT	2	6	180672	180677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884891
3509	NC_021082	AAT	2	6	180744	180749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884891
3510	NC_021082	A	7	7	180856	180862	100 %	0 %	0 %	0 %	482884891
3511	NC_021082	TCA	2	6	180863	180868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884891
3512	NC_021082	TAG	2	6	180925	180930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884891
3513	NC_021082	ATG	2	6	180950	180955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884891
3514	NC_021082	TAA	2	6	180977	180982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884891
3515	NC_021082	GCT	3	9	181053	181061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884891
3516	NC_021082	AGCA	2	8	181075	181082	50 %	0 %	25 %	25 %	482884891
3517	NC_021082	AAT	2	6	181106	181111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884891
3518	NC_021082	ACT	2	6	181123	181128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884891
3519	NC_021082	ATT	2	6	181162	181167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884891
3520	NC_021082	GAC	2	6	181224	181229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884891
3521	NC_021082	CAATT	2	10	181241	181250	40 %	40 %	0 %	20 %	482884891
3522	NC_021082	TTG	2	6	181402	181407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884891
3523	NC_021082	AAT	2	6	181498	181503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_021082	ATC	2	6	181520	181525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_021082	GTT	2	6	181526	181531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021082	TTTC	2	8	181592	181599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3527	NC_021082	ATTTT	2	10	181625	181634	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021082	AATTT	2	10	181639	181648	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_021082	TTG	2	6	181736	181741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884892
3530	NC_021082	TTC	2	6	181748	181753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884892
3531	NC_021082	TCTT	2	8	181802	181809	0 %	75 %	0 %	25 %	482884892
3532	NC_021082	ATT	2	6	181835	181840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884892
3533	NC_021082	TTTAC	2	10	181857	181866	20 %	60 %	0 %	20 %	482884892
3534	NC_021082	T	6	6	181874	181879	0 %	100 %	0 %	0 %	482884892
3535	NC_021082	CAA	2	6	181915	181920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884892
3536	NC_021082	TAT	2	6	182017	182022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884892
3537	NC_021082	GCCAA	2	10	182114	182123	40 %	0 %	20 %	40 %	482884892
3538	NC_021082	ACA	2	6	182143	182148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884892
3539	NC_021082	A	6	6	182150	182155	100 %	0 %	0 %	0 %	482884892
3540	NC_021082	TTG	2	6	182297	182302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884892
3541	NC_021082	ATT	2	6	182309	182314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884892
3542	NC_021082	TTC	2	6	182365	182370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_021082	AAG	2	6	182374	182379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021082	AATA	2	8	182414	182421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_021082	CT	4	8	182436	182443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_021082	TC	4	8	182472	182479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_021082	GA	3	6	182489	182494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_021082	GTA	2	6	182559	182564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884893
3549	NC_021082	CAT	2	6	182592	182597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884893
3550	NC_021082	ACC	2	6	182671	182676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884893
3551	NC_021082	GCTG	2	8	182723	182730	0 %	25 %	50 %	25 %	482884893
3552	NC_021082	CTTTGT	2	12	182813	182824	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	482884893
3553	NC_021082	CCCG	2	8	182951	182958	0 %	0 %	25 %	75 %	482884893
3554	NC_021082	TCACC	2	10	182993	183002	20 %	20 %	0 %	60 %	482884893
3555	NC_021082	CAA	2	6	183011	183016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884893
3556	NC_021082	GA	3	6	183020	183025	50 %	0 %	50 %	0 %	482884893
3557	NC_021082	GCC	2	6	183048	183053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884893
3558	NC_021082	ACGC	2	8	183081	183088	25 %	0 %	25 %	50 %	482884893
3559	NC_021082	CAAT	2	8	183094	183101	50 %	25 %	0 %	25 %	482884893
3560	NC_021082	GAAA	2	8	183132	183139	75 %	0 %	25 %	0 %	482884893
3561	NC_021082	TGCC	2	8	183164	183171	0 %	25 %	25 %	50 %	482884893
3562	NC_021082	TCT	2	6	183208	183213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884893
3563	NC_021082	GTGG	2	8	183237	183244	0 %	25 %	75 %	0 %	482884893
3564	NC_021082	TTG	2	6	183255	183260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884893
3565	NC_021082	CTT	2	6	183263	183268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884893
3566	NC_021082	A	6	6	183352	183357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_021082	T	6	6	183451	183456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_021082	CCT	2	6	183584	183589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_021082	TGA	2	6	183652	183657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884894
3570	NC_021082	ATG	2	6	183678	183683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884894
3571	NC_021082	GAAC	2	8	183719	183726	50 %	0 %	25 %	25 %	482884894
3572	NC_021082	GAA	2	6	183761	183766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884894
3573	NC_021082	TGAAGA	2	12	183805	183816	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	482884894
3574	NC_021082	GAT	2	6	183851	183856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884894
3575	NC_021082	GTTT	2	8	183906	183913	0 %	75 %	25 %	0 %	482884894
3576	NC_021082	CCG	2	6	183964	183969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884894
3577	NC_021082	ATTG	2	8	183976	183983	25 %	50 %	25 %	0 %	482884894
3578	NC_021082	ATTT	2	8	184011	184018	25 %	75 %	0 %	0 %	482884894
3579	NC_021082	AGC	2	6	184032	184037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884894
3580	NC_021082	GAA	2	6	184052	184057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884894
3581	NC_021082	ATG	2	6	184125	184130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884894
3582	NC_021082	AAT	2	6	184238	184243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884894
3583	NC_021082	T	6	6	184324	184329	0 %	100 %	0 %	0 %	482884894
3584	NC_021082	TTC	2	6	184382	184387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884894
3585	NC_021082	GGT	2	6	184390	184395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884894
3586	NC_021082	TTG	2	6	184509	184514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884894
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3588	NC_021082	ATTT	2	8	184561	184568	25 %	75 %	0 %	0 %	482884894
3589	NC_021082	TAT	2	6	184657	184662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_021082	AT	3	6	184671	184676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021082	TAT	2	6	184710	184715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884895
3592	NC_021082	TAAG	2	8	184718	184725	50 %	25 %	25 %	0 %	482884895
3593	NC_021082	CAT	2	6	184758	184763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884895
3594	NC_021082	TTAC	2	8	184790	184797	25 %	50 %	0 %	25 %	482884895
3595	NC_021082	AAT	2	6	184816	184821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884895
3596	NC_021082	TCCGAT	2	12	184932	184943	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482884895
3597	NC_021082	AATT	2	8	184968	184975	50 %	50 %	0 %	0 %	482884895
3598	NC_021082	ATT	2	6	184980	184985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884895
3599	NC_021082	TTTG	2	8	185027	185034	0 %	75 %	25 %	0 %	482884895
3600	NC_021082	ATT	2	6	185063	185068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884895
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3604	NC_021082	ATT	2	6	185164	185169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884895
3605	NC_021082	TAAA	2	8	185183	185190	75 %	25 %	0 %	0 %	482884895
3606	NC_021082	AAC	2	6	185194	185199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884895
3607	NC_021082	T	6	6	185225	185230	0 %	100 %	0 %	0 %	482884895
3608	NC_021082	AAC	2	6	185270	185275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884895
3609	NC_021082	ATTA	2	8	185346	185353	50 %	50 %	0 %	0 %	482884895
3610	NC_021082	ATT	2	6	185365	185370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884895
3611	NC_021082	GTT	2	6	185419	185424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884895
3612	NC_021082	ATT	2	6	185478	185483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884895
3613	NC_021082	A	6	6	185487	185492	100 %	0 %	0 %	0 %	482884895
3614	NC_021082	TATT	2	8	185607	185614	25 %	75 %	0 %	0 %	482884895
3615	NC_021082	TTA	2	6	185653	185658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884895
3616	NC_021082	ATT	2	6	185710	185715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884895
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3620	NC_021082	CTA	2	6	186023	186028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884895
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3622	NC_021082	TAG	2	6	186090	186095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884895
3623	NC_021082	A	6	6	186128	186133	100 %	0 %	0 %	0 %	482884895
3624	NC_021082	AT	3	6	186188	186193	50 %	50 %	0 %	0 %	482884895
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3997	NC_021082	AGAA	2	8	207607	207614	75 %	0 %	25 %	0 %	482884917
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